近日，34歲女星吳佩慈已懷孕4個多月，吳佩慈說7月在巴黎走訂製服秀前，發現胸部脹很大，跟之前試衣狀況差很多，那時才確定自己懷孕6周了。據悉，吳佩慈男友紀曉波現爲香港融匯資本有限公司CEO，同時投資礦業、環保事業和房地產，擁百億臺幣資產。
2005年，跟Ted分手後，吳佩慈又跟林志玲前男友設計師蘇點忠交往，他在3年前被林志玲甩掉，吳佩慈當年也表示早已知道男友過去跟林志玲是一對，不過她並不介意。但當時大小S對蘇很有意見，後來，因吳在大陸工作，吳佩慈跟蘇點忠感情轉淡，於2006年4月分手。吳佩慈曾說過，如果男友連身邊朋友這一關都過不了，自己也無法接受，因爲她很重視朋友的建議。
和蘇點忠分手後，吳佩慈又和王仁甫傳出過從甚密，王仁甫是臺灣偶像組合體5566副團長，兩人的曖昧曾一度引起正牌女友季芹吃醋。2009年2月14日，王仁甫和季芹在臺北舉行婚禮，值得一說的是婚禮當天王仁甫已經是一對可愛的兒女的爸爸，兩人也是先生子後補辦婚禮。
2007年她被爆與撒隆巴斯小開施明廷祕密拍拖，當時還傳出男方爲擄獲她歡心，割捨空姐女友。熟悉她的友人都知道，2人私下互動頻頻，短信、電話從未間斷，即使一度傳出保守的男方父母反對，小倆口依舊低調熱戀。據悉，施明廷是家族資產高達十多億元。但2人相戀近1年突然生變，傳因兩人很少見面導致情變。
與施明廷分手後，2009年6月，某集團在上海五星級酒店舉行2009年度盛典。“九頭美女”吳佩慈牽手男朋友PeterChen一起出席，首次公開亮相媒體，並大方接受祝福。
吳佩慈當場向在場媒體表示：“我這次是以家屬的身份來參加男朋友公司的酒會，很開心也很幸福，希望每天都能開心地在一起，謝謝大家的關心和支持。”
據悉，吳佩慈的馬來西亞籍男友Peter身家至少逾億元人民幣，是保利博納和海蝶唱片兩大公司的海外投資商，屬於身價不菲的“多金男”。兩人在飛機上相遇並擦出了火花，戀情甜蜜時，吳佩慈曾一度宣告“他是理想的結婚對象，將在兩年後結婚退出演藝圈”。吳佩慈與富豪男友拍拖四年最終“曲終人散”，曾經兩人愛到癡纏同進同出，更被目擊在上海共築愛巢，屢次傳出結婚消息，而分手原因則是因爲吳佩慈因爲隱瞞男友拍攝大尺度戲份，導致其男友惱火聲稱與其分手。
