一、通过Y染色体DNA遗传关系鉴定，可以进行父系亲缘关系认定。只要是来自于同一父系的个体，其Y染色体基因座完全相同，因此可以确定父系关系。
二、线粒体DNA的遗传标记是通过女性代代遗传，通过线粒体DNA遗传关系鉴定，可以进行母系亲缘关系鉴定。只要是来自于同一母系的个体，其线粒体DNA遗传基因完全相同，从而可以确定母系关系。线粒体DNA的遗传标记是通过女性代代遗传。
三、在通过Y染色体、线粒体DNA遗传关系鉴定，可确定二人是源于同一父系和同一母系。再进行常染色体DNA鉴定，就可以得出排除或支持兄弟关系的结论（兄弟关系鉴定检材最好采用血痕）。
