忽视用药存在个体差异。
对大多数病人而言，每日服用一次质子泵抑制剂(一种强抑酸药)就可以有效控制食管酸反流。但有些病人存在“晚间酸突破”(指发生在午夜至凌晨6时之间的烧心、胸痛、嗳酸症状)。对这些病人来讲，如此用药就不能解决问题。质子泵抑制剂在这些病人体内可能代谢比一般人来得快，这时，就需要在傍晚加用一次质子泵抑制剂或睡前加用H2受体抑制剂。
忽视有效保护受损食管黏膜。
已经受损的食管黏膜需要修复和保护。硫糖铝或碳酸铝镁制剂可以有效保护食管黏膜，但要注意使用方法。服这类药时不能大量用水冲服，而应让其以凝胶状，借助自身重力和食管蠕动，均匀地分布到食管黏膜上。此外，在治疗食管炎时，这类药宜在餐后半小时服用，会更有利于药物在食管内停留，起保护和修复作用。这与药物说明书上的常规用法有所不同。
忽视使用促胃动力药。
有些病人认为，只要强力制止胃酸分泌就可以减轻酸反流，消除食管炎症，因此只要使用强力抑酸药就可以了。其实，酸反流并非全由胃酸引起，胃液里的其他成分包括从十二指肠反流到胃液里的胆汁也是引起食管炎的原因。促胃动力药在维护食管下端高压带压力方面的作用非常重要。虽然促胃动力药初服时有些病人会有轻度腹痛、腹泻，但大多数病人都能耐受。继续用药或调整剂量就会消失。
忽视在适当时机根治幽门螺杆菌。
不少反流性食管炎病人，在知道自己同时有幽门螺杆菌感染时，都强烈要求医生立即剿灭它。殊不知，幽门螺杆菌产生的铵，有中和胃底食管连接处局部酸环境的作用，可能减轻酸对食管的腐蚀。而立即根治幽门螺杆菌，反而可能会加重酸反流。所以，应选择在食管炎基本控制后的适当时机杀灭幽门螺杆菌。
