另外，滴蟲能夠吞噬精子，且患滴蟲性陰道炎時，陰道內膿性分泌物大量增多，分泌物中含有大量的白細胞，這些都會妨礙精子的成活，使精子數量減少。精子數量既少，活動度又不好，就很有可能引起不孕。滴蟲病患者中不孕者約佔19% ，但這並不是不可逆的，大多數人在滴蟲病治癒後，生育能力可以得到恢復。
