直腸脱垂的發病原理學説眾多。目前主要有兩種説法:
1、滑動性疝學説,認為直腸脱垂的發病初期,指診可以摸到疝,直腸脱垂是疝的發生過程,開始是直腸膀胱或子宮凹陷沿直腸向下通過盆底成為滑動性疝,當腹內壓力增大時直腸前壁沿這個凹陷向下滑動,以至脱出到肛門外。
2、學説是腸套疊學説,認為由於直腸、乙狀結腸連接處發生腸套疊而引起,這種套疊與一般腸套疊不同,套疊起點無固定部位,因反覆下脱,逐漸向下移位,如乙狀結腸末段下脱,然後直腸末段外翻。臨牀上常見的直腸脱垂套疊的形式較多。