因为含有激素，一直以来，许多人误认为长期服用复方口服避孕药会增加肿瘤的患病风险。但据研究显示，复方口服避孕药具有降低某些妇科肿瘤患病风险的作用。如世界卫生组织的一个专题工作组近期发布的公告就指出，复方口服避孕药通过抑制排卵和降低血清促性腺激素水平，能起到预防卵巢癌的作用。
雌激素在低剂量使用时，能够抑制子宫内膜的过度增生，使子宫内膜定期脱落、排出，并能修复内膜，减少月经周期中不规则出血，孕激素则可转化内膜，从而降低女性患子宫内膜癌的风险。此外，大量最新临床试验资料都显示，像复方口服避孕药这样低剂量的避孕药并不会增加乳腺癌的风险，对于宫颈癌，也没有任何明确的报告指出它的影响因素中有与雌孕激素有关的。
研究表明，复方口服避孕药对于许多女性妇科疾病有积极的作用。例如它可以通过抑制排卵，使机体激素水平在月经周期中相对稳定地处于较低水平，从而改善许多与月经周期相关的症状，包括经前期的头痛、情绪改变(抑郁、易怒、易激动、焦虑等)、乳胀、腹胀和水肿等;另外对于盆腔炎、子宫内膜异位症、多毛卵巢综合征等妇科疾病和由雄性激素分泌过多引起的痤疮、多毛等疾病，在医生的指导下使用，复方口服避孕药亦有一定的治疗效果。
随着医学技术的发展，复方口服避孕药一直在不断地改进，雌激素含量逐渐降低，孕激素则更新换代。最新型的第四代复方口服避孕药产品含有目前唯一与天然孕酮特性相近的孕激素——屈螺酮，含有这一类孕激素的短效口服避孕药，除了优异的避孕效果，还对女性的身体健康有许多积极的影响。
它独有的抗盐皮质激素活性，能够对抗水钠潴留引起的体重增加，从而有效控制体重，摆脱了长期以来使用者所担忧的服用复方口服避孕药会增胖的问题，令女性保持窈窕身姿。它还具有抗雄激素效应，能有效减轻痤疮，令皮肤更为光洁。此外含有屈螺酮的避孕药还可帮助使用者维持规律的月经周期，减少月经出血量，缓解痛经，并对经前期综合征有积极作用。
