因為含有激素，一直以來，許多人誤認為長期服用複方口服避孕藥會增加腫瘤的患病風險。但據研究顯示，複方口服避孕藥具有降低某些婦科腫瘤患病風險的作用。如世界衞生組織的一個專題工作組近期發佈的公告就指出，複方口服避孕藥通過抑制排卵和降低血清促性腺激素水平，能起到預防卵巢癌的作用。
雌激素在低劑量使用時，能夠抑制子宮內膜的過度增生，使子宮內膜定期脱落、排出，並能修復內膜，減少月經週期中不規則出血，孕激素則可轉化內膜，從而降低女性患子宮內膜癌的風險。此外，大量最新臨牀試驗資料都顯示，像複方口服避孕藥這樣低劑量的避孕藥並不會增加乳腺癌的風險，對於宮頸癌，也沒有任何明確的報告指出它的影響因素中有與雌孕激素有關的。
研究表明，複方口服避孕藥對於許多女性婦科疾病有積極的作用。例如它可以通過抑制排卵，使機體激素水平在月經週期中相對穩定地處於較低水平，從而改善許多與月經週期相關的症狀，包括經前期的頭痛、情緒改變(抑鬱、易怒、易激動、焦慮等)、乳脹、腹脹和水腫等;另外對於盆腔炎、子宮內膜異位症、多毛卵巢綜合徵等婦科疾病和由雄性激素分泌過多引起的痤瘡、多毛等疾病，在醫生的指導下使用，複方口服避孕藥亦有一定的治療效果。
隨着醫學技術的發展，複方口服避孕藥一直在不斷地改進，雌激素含量逐漸降低，孕激素則更新換代。最新型的第四代複方口服避孕藥產品含有目前唯一與天然孕酮特性相近的孕激素——屈螺酮，含有這一類孕激素的短效口服避孕藥，除了優異的避孕效果，還對女性的身體健康有許多積極的影響。
它獨有的抗鹽皮質激素活性，能夠對抗水鈉瀦留引起的體重增加，從而有效控制體重，擺脱了長期以來使用者所擔憂的服用複方口服避孕藥會增胖的問題，令女性保持窈窕身姿。它還具有抗雄激素效應，能有效減輕痤瘡，令皮膚更為光潔。此外含有屈螺酮的避孕藥還可幫助使用者維持規律的月經週期，減少月經出血量，緩解痛經，並對經前期綜合徵有積極作用。
