同一種飲水，炮製方法不同，功效各異。如大黃生用峻瀉直達下焦，而蒸炙為熟大黃，瀉下作用明顯減弱，適用於老人、小兒便祕;
炒成大黃炭，不但沒有瀉下作用，反而有止血、止瀉及收斂作用。又如生麻黃解表，麻黃止咳平喘，等等。
藥物不能互相代替
同一類藥，藥性有別，也不能互相代替作用。如川貝母和浙貝母，同為貝母類，但川貝母偏重於治陰虛肺燥的虛證咳嗽，而浙貝母側重於治外感及內熱咳嗽，還可以解一切瘡瘍腫毒。又如茯苓和豬苓、胡黃連和黃連等。
同一植物的藥材生長期和採摘期不同，或生長部位不同，功效也各異。比如枳實和枳殼，同為芸科植物酸橙的果實，而枳實為乾燥的幼果，枳殼為成熟的果實，同為行氣藥，但藥力不同。
又如柏子仁和側柏葉、蘇梗和蘇葉等均不能互相代替。
有些藥名相近，但不屬於同一類藥物。例如桑螵蛸和海螵蛸，桑螵蛸為螳螂科昆蟲刀螂的卵鞘，具有補腎、固精的功效;
而海螵蛸為烏賊科動物烏賊的內殼，具有除濕制酸、止血斂瘡的功效。如北柴胡和銀柴胡、山茱萸和吳茱萸、百合和百部等，都不能互相代替使用。
