防範秋季腹瀉寶寶在夏天最易腹瀉，但入秋以後腹瀉發病率也同樣頻繁，常在9月或10月侵襲孩子消化道而導致的腹瀉被稱為“秋季腹瀉”。因此，家長不能有任何鬆懈。
秋季腹瀉完全可以預防，父母應幫助孩子把握以下幾點：首先是堵住口入關。具體措施包括注重飲食衛生、不吃生冷食物、定期給玩具和食具煮沸消毒、在給寶寶餵奶之前母親要用溫開水洗淨乳頭等。同時，還應搞好環境衛生，消滅傳播病毒的媒介物。此外，如果發現寶寶有腹瀉情況應立即隔離治療，處理好排洩物，同時也儘可能避免健康兒童與患病寶寶接觸。
及時打預防針秋天要及時打預防針，以防範冬春季節的傳染病，比如：流腦等。因為疫苗注射後至少也要一個月體內才能產生抵抗傳染病的抗體，所以秋季不可忘記給寶寶預防接種，如果漏掉者應該及時補上。
增加營養補給夏季100多天的炎熱氣候，使孩子的飲食和睡眠都受到不同程度的影響，因此往往也減緩了其生長髮育速度。然而當秋天到來天氣轉涼後，對睡眠和飲食的干擾就不存在了，機體也會逐漸恢復到以前良好的運作狀態，寶寶的食慾和消化功能也能自動調節到最佳水平，因此這個時節應該給孩子強化營養供給，為孩子生長加加“油”。在飲食上，肉、蛋、奶等食物都不可缺少，同時，蔬菜、瓜果等也應該增加，同時做到主食和副食、葷菜和素菜、粗食和細糧合理搭配。
驅蟲最好時機蛔蟲乃是眾所周知的危害寶寶健康的“公敵”，不僅掠奪營養，還會誘發貧血、營養不良等疾病，導致孩子體格發育落後，損害智力。
專家認為在一年四季裡，秋天是驅除蛔蟲的最好季節。雖然寶寶一年四季都有可能遭受蟲卵感染，但在夏季裡感染機會最多，比如吮吸手指等都可能導致蟲卵進入體內，經過一段時間的演變，變為成蟲定居小腸。因此，如果在秋天服用打蟲藥是將其“一網打淨”的最好時機，而且不留後患。
冷水擦洗身體經常用冷水擦洗對提高寶寶的冷適應能力非常有效。冷水擦洗包括冷水洗手、洗臉、擦身、衝淋和游泳等。冷水擦洗的鍛鍊對孩子來說因年齡而異，注意循序漸進。起初，可以先用和體溫接近的溫水，然後逐漸降溫，比如洗臉、洗腳的水溫度可以從35度開始逐漸降至28度、26度左右，洗完後用乾毛巾擦乾。而冷水衝淋也是一種強身效果很好的鍛鍊方法，但動作要迅速，浴後應用乾毛巾擦身至身體發熱並輕度發紅為止，但這種方法僅適合3歲以上的兒童。
