引起卵巢囊腫的原因有以下幾點
一、內分泌因素
在日常生活中，卵巢囊腫一般出現在未產婦或未育婦的身上比較做，並且隨着時間流逝這樣的患者越來越多，而妊娠對卵巢癌似有保護作用;月經初潮偏早、絕經時間在50歲之後、月經過頻、應用促排卵劑超過3個週期、性早熟或男性化等也與卵巢囊腫的原因有關。這些都是常見的引起卵巢囊腫的原因。
二、環境因素
膳食結構不合理，高膽固醇飲食、而維生素A、C、E的缺乏、吸菸、電離輻射等環境因素與其發生有關。
三、長期的飲食結構
生活習慣不好、心理壓力過大等因素造成體質過度酸化，人體整體的機能下降，引起腎虛，肝腎同源，腎卵巢囊腫病理虛肝亦虛，進而引起下焦代謝循環變慢，造成卵巢疾病和內分泌失調，免疫功能下降，從而發展爲卵巢組織異常增生，終致卵巢囊腫，甚至癌變。
四、身體組織液酸化
細胞處於酸性體液中，進而身體正常細胞溶氧量下降，造成細胞的活性下降，代謝循環減慢，下降到正常值的65%時，正常細胞就無法生存，但也有不惜改變染色體採取主動變異的細胞，細胞的表型發生改變，這些細胞迅速擴增，從而形成真正的腫瘤實體。
五、遺傳和家族因素
有四分之一的卵巢囊腫患者在其直系的親屬當中，就會有腫瘤的患者，這也是導致卵巢囊腫病因之一。
