1.髮型設計：自體毛髮移植手術首先設計整體髮型線及移植部位的髮型。測量儀在後枕部測量頭髮的密度，根據每平方釐米頭髮的數量，算出所提取毛囊組織的面積。再就是自體毛髮移植手術毛囊的提取，清潔頭皮後，醫師在後枕部進行局部麻醉注射，提取移植的毛囊。
2.自體毛髮移植手術分離毛囊：這一部份自體毛髮移植手術最關鍵也最辛苦，目前仍然以人工方式處理，皮辧取下以後，必須分離出一株株的毛囊單位。分離時間愈短毛囊移植後的存活率愈高，也需要精細的技巧， 避免在分離時傷害到毛囊。
3.將毛囊植入頭皮：這又是自體毛髮移植手術很傷眼力的工作，醫師必須先在前額禿髮區作顯微切口，再將毛髮一株一株植入。目前還是以人工植入的存活率最高，密度最好，這需要相當的技術，種壞了就無法補救。
4.自體毛髮移植手術後護理：自體毛髮移植手術後可以馬上回家，無需包紮，自體毛髮移植手術24小時後就可用涼開水沖洗頭髮，第4天就可以正常洗頭，第10天后拆除後枕部的縫線。
自體毛髮移植手術後種入的頭髮暫時進入休止期，等待2～3月後會開始長出新頭髮，自體毛髮移植手術植入的頭髮有正常的生理特性，會永久生長、不受到男性荷爾蒙代謝的影響。
成功的自體毛髮移植手術，毛囊的存活率可高於95%，因爲對於雄性禿患者來說，每一根頭髮都很寶貴，禁不起隨便耗損。
