急性腎炎是一個自限性疾病，一般預後良好，只要及時去除病因，輔以適當的治療，在兒童約85%～90%，在成人約60%～75%可完全恢復。
老年人患急性腎炎的機會不多，但其預後在急性腎炎患者中最差。多數病例尿常規改變在3～6個月內恢復，少數患者急性期後臨牀表現消失，腎功能良好，但尿液中紅細胞和少量蛋白可遷延1～2年才逐漸消失。少數病例病程遷延1～2年後逐漸康復，另有少數病人遷延發作轉為慢性腎炎，個別病例急性期可發生嚴重合並症而死亡。近年來由於防治工作的改進，死亡率已降至1%～2%，甚或無死亡。
某些急性腎炎雖然存在自然痊癒的可能，但是絕不能因此而麻痺大意，尤其是有些腎炎可以發展成急進性腎炎（預後差）或者進展為慢性腎炎、腎功能衰竭，故積極防治急性腎炎仍然具有十分重大的意義。
