陰莖的大小主要是受遺傳因素的影響，真性男性陰莖短小症是多見於先天性，少數爲後天的。先天症的有睾丸發育不全症又稱克氏綜合症。
從美國性醫學專家的統計來看，擁有短一點陰莖的男子，性能力不弱反強。
假如陰莖長，那麼要讓其性能力保持較強狀態，它就必須比較厚實，這樣才能堅挺。但可惜的是，統計顯示，較長的陰莖大多不夠厚實，所以也就不夠硬挺。即便陰莖長且硬，也容易在猛烈的性生活中出現折斷或彎曲的問題，增加男性性安全隱患，同樣影響快感。
若陰莖較短，一般就會較粗，從而增加了性生活的安全性，此外因爲較短所以海綿體供血更充分，所以一般硬度會更佳，並且，因爲男性感受性交快感的神經主要分佈在陰莖頭部冠狀溝遠端2—3釐米的範圍內，而女性陰道的感覺神經末梢主要分佈在外1/3部分，內2/3部分幾乎感覺不到性快感，所以，陰莖較短反而更有利。國內的調查認爲，我國男性青壯年陰莖勃起後的長度多在10—19釐米範圍內。
陰莖大小不會與身高或體重成正比，常態下陰莖體積較小的男性，勃起後長度反而可以增加許多，大多能滿足正常性生活的要求。所以，陰莖大小不足以成爲決定性生活美滿程度的標誌。有人擔憂陰莖較短會影響性能力，就胡亂服用性激素或中藥，這樣不僅無助於增大陰莖，還可能由此造成很多嚴重副作用，研究表明一般充分勃起後陰莖長度大於8釐米即可正常完成性交，及生兒育女。
