隱睾只有通過手術才能治療。隱睾中 2/3 是單側（右側佔70%，左側30%），1/3 是雙側者。按位置腹內者佔8%，腹股溝管內佔72%，而陰囊上側佔20%。睾丸不發育或無睾佔2.6%。
隱睾手術時應注意睾丸位置及形態，充分自腹膜後遊離精索及輸精管以便把睾丸放入陰囊內而無張力，如有張力則需將睾丸固定於陰囊。
隱睾常用的手術方法有：
1.睾丸切除術：高位隱睾已呈萎縮狀態，或成人隱睾，應儘早做隱睾切除，以防發生癌變。
2.睾丸自體移植：因精索太短，睾丸位置太高，鬆解後仍不能牽入陰囊內進行固定，則可將隱睾連同血管一同取下來，移植到陰囊內，在手術顯微鏡下將睾丸血管與陰囊附近的血管吻合，以維持睾丸的血液循環。
3.睾丸固定術：適用於2～5週歲，激素治療無效者和單側隱睾。單側隱睾多是由於精索、血管、輸精管短或粘連等機械性因素所造成的，故必須手術治療。手術方法是鬆解睾丸及精索周圍組織，將睾丸牽拉入陰囊內，加以固定。
手術的目的，不僅在於恢復正常的睾丸位置，更重要的是恢復睾丸的正常組織和生精功能。如能在2～5歲手術，則約80%的病例保有生育能力。
因此，應該儘早治療。若是等到成年了，隱睾就有癌變的可能，此時只能放棄生育能力，進行切除手術。
