魯邦三世vs名偵探柯南是2009年和2013年龜垣一執導的電視動畫片，該影片將魯邦三世和名偵探柯南這兩個備受矚目的主角相融合，以此紀念電視臺成立。雖然魯邦三世和名偵探柯南進行了兩次動畫合作，但雙方並不在彼此的正式系列中，因此現在的名偵探柯南TV裏看不到魯邦三世的身影。
一、2009版魯邦三世vs名偵探柯南
2009版魯邦三世vs名偵探柯南採用了跨時代的穿越劇情，影片主要講述了柯南收到國王的委託，進入城堡調查案件，不過就在調查的過程中碰到了魯邦三世一行人偷盜寶藏，一位是機智勇敢的名偵探，一位是萬年神偷魯邦三世，二人一攻一防，如此巔峯對決吊起了不少粉絲胃口。
魯班三世按年齡推算可以當柯南的爺爺了，但爲了使劇情更加驚豔，製作方雙雙聯合，這纔有了特別版影片，在這一部電影中粉絲們也可以看到，除了人物造型之外，故事情景完全抽離原動畫，重新講述了另一個新的故事，一正一邪的組合頗具矛盾但十分新穎，使影片獲得了很棒的口碑。此片爲二人的首次合作，雖有穿越之感，但反響不錯。
二、2013版魯邦三世VS名偵探柯南THE MOVIE
2009版高口碑收官，2013年龜垣一再次執導衍生電影，劇情延續第一部核心線索，講述了魯邦三世將犯罪預告書交到警方手中後，企圖盜走櫻桃藍寶石，途中碰巧遇到了江戶川一行人，伴隨5萬人體育館的演唱會，陰謀和逐漸浮出了水面。該影片爲紀念日本電視臺60週年臺慶所作，魯邦三世與名偵探柯南第二次合作繼續講述雙方對決的激烈故事，兩部作品的情節有很大關關聯，第二部作品最後票房以42.6億元完美收官，並獲得了優秀長篇動畫獎。
