凡是藥物都有一定的不良反應，切勿盲目服用。其中，奧利司他特異性地作用於腸胃，幾乎不進血液，所以不良反應較小，但仍有胃腸脹氣、腹痛、大便排油等腸胃道不適反應，還可影響脂溶性維生素、鉀等的吸收。
故奧利司他使用期間應注意維生素、礦物質的補充，且不宜長期應用。西布曲明除了可導致口乾、視力模糊、頭暈、出汗、睡眠障礙和偏頭痛外，還可引起心血管系統異常，如心悸、心動過速、心律失常、高血壓等不良反應。
此外還要注意，美國已禁止使用含麻黃類成分的減肥藥，因爲麻黃會加重心臟負擔並可能導致死亡。“我國已於今年1月7日起禁止生產、銷售使用含鹽酸芬氟拉明的減肥藥。”
奧利司他和西布曲明均是處方藥，須憑醫生處方購買，按醫囑服藥。爲減少或避免不良反應，一般應先從小劑量開始服藥，逐漸加量，直至最合適劑量，以達到既有效減輕體重，又將不良反應降至最小的目的。
