藥物流產前做B超十分必要，這既可爲藥物流產提供準確依據，也可提高藥物流產的安全度和成功率。
藥物流產的合適時間是在妊娠49天以內。在適合期內，其效果與懷孕天數成反比，即懷孕天數越多，流產效果越差；天數越少，效果越好。B超可以顯示胎囊，以估計妊娠時間。胎囊平均直徑小於20毫米，說明停經時間少於49天，藥流效果較好；如果胎囊過大，藥流效果不好，而且危險性增大。
另外，單憑臨牀表現及妊娠試驗陽性診斷早孕，混於其中的少數異位妊娠、葡萄胎或子宮畸形等，難以發現，可能造成誤診，如果也當作早孕進行藥流，輕則延誤真正疾病的發現，重則如宮外孕，導致孕囊破裂大出血，可危及生命。所以藥物流產前應進行B超檢查。有的女性不願做這項檢查，自己服打胎藥的做法是危險的。
