肛瘻術後的治療時間的長短，與瘻管的大小，病情的複雜程度，病人的體質情況及手術方法有密切關係。一般來說，皮下肛瘻術後2周左右可治療，單純性低位肛瘻，大約需3周左右的時間才能漸愈;少數高位性難治瘻，療程就相對更長一些。
肛瘻手術後應注意的事項：
1.注意肛門部的清潔衛生，堅持便後坐浴：肛門直腸仍需要一個相對清潔的環境，所以主張肛門直腸部手術，出院以後便後及時清洗、中藥坐浴或換藥，既可減少排便時直接對創面的刺激，又可減少污染的機會，同時配合局部按摩，促進創面癒合。
2.適當休息，避免過勞：休息對減輕術後出血及肛門局部症狀十分重要，因此我們建議患者適當休息，並避免重體力勞動。
3.清淡飲食，注意飲食衛生： 忌食辛辣刺激性食物一月，如酒、蔥、大蒜、辣椒等。而應食含纖維素豐富的食物，如青菜、竹筍等。 少食魚、蝦、蟹等發物及油煎燻烤的食物。宜多食清淡易於消化的食物以及新鮮水果和新鮮蔬菜，飲食應注意純潔，避免腹瀉。
