（1）上尿路結石：如腎結石和輸尿管結石常表現爲腰部或腹部疼痛。輕則感腰部酸脹或不適，重則呈嚴重的刀割樣疼痛，這種疼痛似乎極少有人能夠忍受，醫生稱之爲腎絞痛。常突然發作，疼痛常向下腹部、腹股溝、股內側放射，女性則放射至陰脣部位。絞痛發作時，病人常表情痛苦異常，雙手緊壓腹部和腰部，捲曲在牀，甚至在牀上翻滾，呻吟不已，大汗淋漓。發作常持續數小時，但亦可數分鐘即自行緩解。同時多伴噁心、嘔吐和血尿，有時自排尿開始到結束都能看見肉眼血尿，尿液呈鮮紅色、茶葉水色或洗肉水色，但多數血尿只能在顯微鏡下發現。
（2）下尿路結石：包括膀胱結石、尿道結石。它們的症狀各不相同。①膀胱結石常表現爲排尿中斷和排尿疼痛。疼痛爲下腹部和會陰部鈍痛，亦可爲明顯或劇烈疼痛，排尿終末時疼痛加劇，同時可伴終末血尿。患者常欲臥位以求疼痛緩解。結石若嵌於膀胱頸口，則出現明顯排尿困難，亦可排尿中斷或發生急性尿瀦留，患者必須改變體位或搖晃身體，才能繼續排尿，此時突然發生劇痛，可放射至陰莖、陰莖頭和會陰部。小兒膀胱結石患者，當結石嵌頓時，常疼痛難忍，大汗淋漓，大聲哭叫，用手牽拉或搓揉陰莖或用手抓會陰部，並變換各種體位以減輕痛苦。②尿道結石表現爲排尿困難，呈滴瀝狀，有時出現尿流中斷及尿瀦留。排尿時有明顯的疼痛，而且放射至陰莖頭部。後尿道結石有會陰和陰囊部疼痛。陰莖部結石在疼痛部位可摸到腫塊，用力排尿有時可將結石排出。併發感染者尿道有膿性分泌物。女性尿道憩室結石，常有尿頻、尿急、尿痛、膿尿和血尿；性交痛爲突出的症狀。男性尿道中結石除尿道有分泌物及尿痛外，在陰莖的下方可出現一逐漸增大且較硬的腫塊，有明顯壓痛但無排尿梗阻症狀。
無論上尿路還是下尿路結石，都可能造成不同程度的局部損害、梗阻和感染。當尿路梗阻嚴重，引起巨大腎積水時，患者會感到腰痠、腰脹，甚至可以摸到腰部腫塊。當發生尿路感染時還可出現尿頻、尿急、尿痛，嚴重時出現發熱的症狀。
