1、泌尿系梗阻腎結石結石致泌尿系管腔內堵塞可造成梗阻部位以上的積水。結石性梗阻常爲不完全性梗阻，有的結石表面有小溝，尿液可沿小溝通過;有時結石雖較大，甚至呈鑄狀結石，但尿仍能沿結石周圍流出，也可能在長時間內不引起積水，腎盂壁纖維組織增生變厚時，則擴張表現不明顯。
2．局部損傷 小而活動度大的結石，對局部組織的損傷很輕，大而固定的鹿角狀結石可使腎盞、腎盂上皮細胞脫落，出現潰瘍、纖維組織增生、中性粒細胞和淋巴細胞浸潤，以致纖維化。移行上皮細胞長期受結石刺激後，可發生鱗狀上皮細胞化生、甚至可引起鱗狀上皮細胞癌，因此應做尿脫落細胞學檢查。儘管尿脫落細胞異常不一定能使之確診，但從中可獲得尿路上皮細胞發生異常改變的提示。對於長期存在的腎盂或膀胱結石都要想到上皮細胞癌變的可能，手術時應取活體組織送快速冰凍切片檢查。
3．感染有無感染對腎結石的治療和防治有重要意義。尿路感染病人臨牀表現爲發熱、腰痛、尿中出現膿細胞。尿培養有細菌時，應同時做藥敏試驗。
4．腎功能不全腎結石在合併尿路梗阻時，尤其是雙側尿路梗阻或在此基礎上合併嚴重感染，病人可出現腎功能不全。當梗阻解除和（或）感染得到有效控制，部分病人。腎功能可好轉或恢復正常。
5．腎鈣質沉積症鈣質在腎組織內沉着，多發生於有高血鈣患者。原發性甲狀旁腺功能亢進、腎小管酸中毒和慢性腎盂腎炎患者，可有腎鈣質沉澱。鈣質主要沉澱在髓質內。病變嚴重時，全部腎實質都可有鈣沉着，導致間質纖維化，腎小球硬化和腎小管萎縮。
6．腎組織爲脂肪組織代替腎結石腎盂腎炎的腎組織萎縮後可爲脂肪組織所代替。腎臟維持其原形但普遍縮小。腎包膜與腎的表面緊密粘連，腎組織萎縮而硬化。嚴重病例所剩腎組織極少，甚至完全消失。腎實質與腎盂腎盞間爲灰黃色的脂肪組織所以填充。
7．胃腸道症狀、貧血等。
