治療糞類圓線蟲病可以應用藥物，常用的有驅蟲藥控制感染，緩解症狀，廣譜驅蟲藥噻苯咪唑是治療糞類圓線蟲的首選藥物，對本病的治療效果最好，治癒率達95%以上，還可以應用丙硫咪唑，治癒率也達90%以上，噻嘧啶、左旋咪唑也有一定的療效。
如果重症患者有營養不良、貧血、水腫或者脫水，應當積極的給予營養支持治療，輸液輸血，糾正水電解質紊亂，積極防治休克、呼吸衰竭等。驅蟲前不能夠使用免疫抑制劑，防止自身感染和感染擴散等。
