甲肝容易與這些疾病混淆
急性甲型肝炎與乙型肝炎、丙型肝炎鑑別不難。甲型肝炎一般呈流行或暴發，以學齡前兒童及青壯年多見，起病急，常有發熱，病前有可疑不潔飲食史，而乙、丙型肝炎多爲散發，以成人爲主，多無發熱。
甲型肝炎與戊型肝炎有時不易鑑別，戊型肝炎亦呈流行或暴發，亦有不潔飲食史，但發病年齡以15～39歲年齡組爲多，且淤膽型的比例較高，而鑑別診斷的主要依據是病毒特異性免疫學檢測。
急性甲型肝炎並須與EBV感染相鑑別，後者發熱時間較長，常有咽峽炎、淋巴結腫大、異型淋巴細胞增多、噬異凝集試驗陽性、抗-HAVIgM陽性等。在鑑別診斷時，還應考慮到全身感染性疾病如傷寒、敗血症等出現的肝大、黃疸、肝功異常。如患者系孕婦尚須與妊娠急性脂肪肝相鑑別，該病見於初產婦，於妊娠後期發病，有深度黃疸，急性腹痛，出血傾向，肝腎綜合徵及昏迷等臨牀表現，尿膽紅素陰性，超聲波呈典型脂肪肝波形。
此外，急性重型甲型肝炎須與中毒性及藥物性肝炎相鑑別，主要根據病前有無誤食毒物或用藥史。
區別甲肝看這2個時期
黃疸期
起病急，有畏寒、發熱、全身乏力、食慾不振、厭油、噁心、嘔吐、腹痛、肝區痛、腹瀉、鳥色逐漸加深，至本期末程濃茶狀。少數病例以發熱、頭痛、上呼吸道症狀等爲主要表現。本期持續1-21日，平均5-7日。
自覺症狀可有所好轉，發熱減退，但尿色繼續加深，鞏膜、皮膚出現黃染，約於2周內達高峯。可有大便顏色變淺、皮膚騷癢、心動過緩等梗阻性黃疸表現。肝腫大至肋下1-3cm，有充實感，有壓痛及叩擊痛。部分病例有輕度脾腫大。本期持續2-6周。
恢復期
黃疸逐漸退，症狀減輕以至消失，肝、脾回縮，肝功能逐漸恢復正常。本期持續2周至4個月，平均個月。色繼續加深，鞏膜、皮膚出現黃染，約於2周內達高峯。可有大便顏色變淺、皮膚騷癢、心動過緩等梗阻性黃疸表現。肝腫大至肋下1-3cm，有充實感，有壓痛及叩擊痛。部分病例有輕度脾腫大。本期持續2-6周。
