只要是人工流產的方法都是有副作用的，尤其是對母體子宮內膜不可避免地造成損傷，術後若不注意加強自我保健，則可導致腰痠腹痛、月經紊亂、閉經等。人工流產副作用主要是感染和不孕，感染與手術器械消毒不嚴格有很大的關係的，因此手術後需要消炎。
人工流產副作用是對女性可造成生理和心理雙重的傷害，生理的傷害可以發生在手術中、手術後，嚴重的甚至影響女性終生。比如術中可能發生的出血、人流綜合徵、子宮穿孔、羊水栓塞等;術後可能發生生殖道感染、晚期出血等;心理的傷害也比較常見，以術前的焦慮和術後的抑鬱最爲常見。有關不孕主要與操作不當有關比如造成輸卵管堵塞子宮內膜過薄，如果是多次人工流產將來可能造成流產或早產，不僅影響胎兒，更加危害健康。
平凡來說，人工流產後優異要等1年後再懷孕爲好，如有特殊情報，最低也要等候半年後再懷孕。人工流產副作用是因爲各種人工流產都要進行吸宮或刮宮，以便將宮腔內胚胎構造清除整潔。在人工流產手術過程中，子宮內膜會受到不同程度的侵害，術後必須有一個復原過程，如過早地再次懷孕，如今子宮內膜尚未貫徹復原，難於維持受精卵着牀和發育，因而垂手引起流產。
專家提醒廣大女性慎做人工流產，積極採取正確的避孕措施，以防人工流產副作用的發生，影響女性的健康，否則人工流產副作用會引起一生的遺憾。人工流產是女性避孕失敗不得已的一種補救措施，現在的超導無痛可視人流和宮腔鏡取胚術安全、簡便，因而在臨牀上也是常用的中止妊娠的手段。但是人工流產只是一種補救手段，而決非首選的上策。這是因爲，人工流產可能引起不孕，子宮內膜異位症，子宮穿孔，宮腔粘連等等.
