肛周膿腫的症狀是肛門燒灼痛或跳痛，排便或行走時加重，少數有排尿困難。可伴有發冷、發熱、全身不適等症狀。B超可測及膿腔。 血白細胞及中性粒細胞計數增多。肛門周圍有硬結或腫塊，局部溫度增高、壓痛或有波動。位於肛提肌以上的膿腫，直腸指檢可觸及壓痛性腫塊，直腸內穿刺可抽出膿液。
肛周膿腫如何診斷：
①擠壓法：即採用分葉狀肛門鏡擴張暴露膿腫部位的隱窩，然後壓迫膿腫，以觀察膿汁排出之所在，即可確定內口。
②雙合診：把食指插入肛管，拇指在皮膚觸摸，膿腫波動員明顯的皮膚及粘膜最薄區，即是區口、外口的位置。
③肛門鏡檢查：可見肛隱窩局部充血，可有膿性分泌物。
④探針檢查：在肛門窺器下，用探針鉤隱窩，較易進入，且有溢膿者，即爲內口。也可在術中，切開引流時探及內口。操作中要切忌暴力，以免造成人爲的假內口，致使手術失敗。
⑤亞甲藍溶液染色。
