臨牀上診斷尖銳溼疣時要慎重，因爲男性的陰莖珍珠狀丘疹病和女性的假性溼疣容易與尖銳溼疣混淆，其主要區別如下。
（1）疾病的病因不同 珍珠狀陰莖丘疹病和女性假性溼疣是一種良性皮膚髮育不全的狀態，生理性變異，在正常人羣中有10%的人有此病。據調查，在處女和沒有過性接觸的男性中，本病的患病率也很高。本病不是由性接觸而感染的，不屬於性傳播疾病範圍。尖銳溼疣，是由於人乳頭瘤病毒感染引起的慢性增生性疾病，可通過性接觸而感染的，是性傳播疾病中的一種。
（2）臨牀表現不同 男性珍珠狀陰莖丘疹病的特點，是在沿冠狀溝龜頭緣處分佈的小米粒大小的丘疹。女性假性溼疣是在小陰脣內側呈對稱性的、條索形的指狀丘疹，分佈稠密，也可呈魚子狀。本病可無任何不適感，不需治療，無傳染性。尖銳溼疣是在男女的外生殖器處散在的，呈菜花狀皮膚疣狀物，分佈無規律性，無明顯瘙癢感，有異味。 陰道內生長的尖銳溼疣可自行出血，有自身傳染性，未經治療本病可繼續發展，其數目越來越多，疣體逐漸增大堵塞陰道口。
專家指出：尖銳溼疣初期就是長粉紅色灰色的小疙瘩、逐漸變大、你要是不確定的話回家用白醋測試下、把白醋塗到疙瘩上2-5分鐘後要是明顯變白或突起就是有尖銳溼疣了。
