雖然治療方式不盡相同，但是二者總的來說，危害確是類似的，包皮過長和包莖容易造成下列不良影響：
1.早泄：最常見於平常包皮掩蓋龜頭，但在勃起時龜頭外露的情況。由於平常龜頭粘膜隱藏於包皮下，龜頭粘膜平常受到的摩擦、刺激較少，使得龜頭粘膜的神經感覺過於敏感。
當性生活時，勃起後龜頭外露，當龜頭和陰道進行摩擦、刺激時就會由於龜頭粘膜神經過於敏感而觸發射精的過早出現，造成早泄。
2.不射精：和包皮過長造成早泄的原因相反，不射精往往是包莖造成的。在這種情況下，由於龜頭受到了皮膚的過分保護，龜頭豐富的神經傳導性刺激、激發性興奮的功能消失或減弱，在性生活中達不到激發射精所需的刺激強度，容易出現不射精。
3.影響排尿功能:嚴重的包莖，包皮開口狹小似針孔，排尿時尿液無法通暢排出，包皮會鼓起如小球，如此反覆容易引尿路感染。
4.容易發生嵌頓性現象:由於包皮口狹小，如將包皮勉強上翻而不及時復位，狹小的包皮口可緊勒在陰莖冠狀溝上，阻礙遠端包皮和陰莖的血液循環，致使陰莖頭和遠端包皮腫脹，時間一長，包皮和陰莖頭會缺血壞死。
5.引發癌症的潛在危險：研究表明，在一些包莖的患者，男性的包皮垢是導致男性陰莖癌、女性子宮頸癌的重要原因之一。
6.影響龜頭的正常發育：在一些包莖的患者，如果出現反覆的尿道口感染，就容易造成包皮和龜頭粘膜的粘連，影響龜頭的正常發育，嚴重的會出現龜頭畸型。
7.誘發陰莖頭包皮炎:因爲包皮下長期積聚污垢與包皮垢，容易讓細菌繁殖生長，引起發炎而紅腫疼痛。
判斷是包莖還是包皮過長，可以通過自我檢查進行確定，方法是：
在陰莖部塗搽肥皂，使包皮內外潤滑，左手固定陰莖，右手將包皮向後推並翻轉，若能順利將包皮上翻，爲包皮過長;若包皮口太小不能上翻，即爲包莖。
要不要割包皮，以醫師的標準來說的話有以下幾個衡量標準：
1.完全或不完全包皮過長，使包皮難以退下與清潔的情況就要割包皮，以免產生併發症。
2.罹患性病，如庖疹、菜花時，就有必要割除，因爲包皮太長可能會使這些病毒藏身包皮 下，導致無法完全根除，一再復發。
3.包皮上出現不正常的斑點變化時，因爲這很可能是陰莖癌的前兆。
4.包皮太長影響到泌尿系統，造成小便困難、尿道口變形，也需要割包皮。
很多人有一個認識誤區：
嬰幼兒包莖會自然痊癒。大多數嬰幼兒3—4歲時由於生殖器官發育及生殖器官的勃起，包皮可以自然翻轉。但是有一部分兒童包皮口非常狹窄，甚至到青春期仍無法自然翻轉。
