男性不孕不育症病因可分爲兩大類：性功能正常性不育症與性功能障礙性不育症。
性功能正常性不育症包括：無精症、重度少精症、精子數正常性不育症、多精子症及精子無力症，統稱爲精液異常性不育症。
性功能障礙性不育症包括：先天性發育異常、心理性、神經性、血管性、內分泌性、藥物性等（總體包括八個方面：生殖器官的發育異常；遺傳性疾病；內分泌功能障礙；免疫功能異常；生殖器官的感染；輸精管梗阻；性功能障礙；理化因素）。
男性不孕不育目前佔生育人口的10%的不育夫婦中，男性不育症約佔30%—40%，並且以每年5%的數遞增。其中精液異常所致的男性不育症約佔70%—80%，所以不懷孕，不會生孩子，不單單指女方，男方也佔相當大的比例。精液異常性不育包括無精、少精、死精、精子活動力低及精不液化、精子畸形等六種證候，對於無精症，必須通過睾丸活檢才能證實是爲是否有生精功能，如果睾丸沒有生精功能，證明是真性無精症，是由下丘腦—垂體—性腺軸（睾丸）生精障礙造成，如先天性發育不良、隱睾症、腮腺炎引起的睾丸、附睾炎症所遺留的後遺症均可引起少精或無精，如果睾丸活檢有生精細胞，證明是假性無精症，可查其病因，排查是否有輸精管阻塞等，通過對症治療，可達治癒。
據英國報道：隱睾患者與環境污染和母親在受孕前濫用避孕藥有關。然而少精和精子活動力低，精不液化與平時的吸菸、酗酒、吃棉籽油、自慰及生殖道感染、精索靜脈曲張症、內分泌疾病及干擾生精功能的各種理化因素有關。
