美國國家癌症研究所的斯蒂芬·奧布萊恩及其同事在上世紀80年代至90年代早期開展了5項長期研究工作，對1833名HIV病毒攜帶者進行了追蹤。由於研究階段先於高效抗逆轉錄病毒療法(HAART)，研究小組可在不受干擾的情況下密切關注艾滋病患者病情的發展。
隨着科學家對艾滋病相關疾病及其與遺傳信息間聯繫研究的深入，研究小組發現某些線粒體DNA基因型與艾滋病的發展速率有關。例如：具有單倍型類羣U5a1和單倍型類羣J等特定變異的患者，其艾滋病的發展速率可比一般人羣提升兩倍。與此相反，具有單倍型類羣H3變異的患者的發展速率則可比一般人羣減緩2倍之多。這爲線粒體與艾滋病發展進程有關的理論提供了有力支持。HIV病毒可導致免疫細胞的死亡，這在細胞內的線粒體只可產生少量能量時更易發生。研究小組成員謝爾?翰德森表示，線粒體產生越少的能量，越能加劇疾病的發展，而單倍型類羣U5a1和單倍型類羣J都可引發線粒體的能量缺失。
研究表明，線粒體DNA測試有朝一日可對HIV病毒攜帶者進行準確診斷，決定病人應在何時開始治療。劍橋大學的HIV研究人員安德魯?利威爾表示，通過研究線粒體DNA的類型可確定哪些病人對HIV病毒的反應更敏感，應比一般建議的時間更早地開始高效抗逆轉錄病毒療法。此外，對線粒體DNA進行掃描也可爲醫生提供幫助，以確定最佳的藥物組合治療。
