關於石炭紀雨林崩潰的原因有幾種猜想，其與氣候變化是有關的。整個石炭紀溫度持續下降，溫度和溼度有所變化。冰川截留了淡水、變化的季風和洋流。板塊運動使淺海變平，使晚石炭紀的大陸變幹。擋住陽光的叢林備分解，分散成了“綠洲”。地球進入了短暫的冰川期，原始的雨林和生物羣倖存了下來，二氧化碳的濃度變得更低。
一、石炭紀氧氣含量降低原因
石炭紀開始於大約3.59億年前，經過5000多萬年的降水期後，蕨類幾乎覆蓋了整個陸地。哪裏有森林，哪裏就會有敗葉。而且，在很長的時間裏，石炭紀的土地由於落下的樹枝與樹葉的發酵，形成了一定的煤層,正是這樣爲雨林的崩潰奠定了基礎。
地殼運動還在繼續，帶來地幔岩漿活動。岩漿的高溫點燃地下煤火，火山噴發造成的垃圾在地面上燃燒，加上濃烈的氧氣助燃，一旦點燃了火，那持續的時間一定很長。正是大火導致了熱帶雨林的毀滅和巨蟲時代的終結。氧氣會被燃燒消耗掉，大量的二氧化碳被釋放出來，所以到石炭紀末期，二氧化碳的濃度急劇上升，幾乎是現在的三倍。
含氧量在石炭紀晚期持續下降。當然，火山噴發和岩漿活動只是科學理論的一部分。科學家們仍有一種理論，認爲在石炭紀末期，冰河期結束了雨林時代，地球開始乾涸。乾旱是森林火災的主要原因之一，因爲雷電或火山爆發都會在森林中引起火災。
二、石炭紀的世界霸主
而這次統治地球的顯然不再是恐龍，而是一種體型較大的昆蟲，表現也更出色。石炭紀開始增加動物的數量，所有生物都經歷了快速發展和推進的時代。爲了更好的生存，所有生物開始被環境影響，從而發展進化。例如，許多水生生物進化到在陸地上尋找食物。有的越來越大，有的越來越小，有的像青蛙一樣在發育肺。
在這種生物快速發展的時候，許多動物的生長和發展在科學的觀點上只是簡單的生物突變。甚至更變態，發展成與原來完全不一致的特徵。但是，即使許多生物爲了生存而進化，它們進化得如此之快，以至於達到了頂峯。它們進化得如此之好，但是也沒有在石炭紀末期逃脫滅絕。除了生命的滅絕，許多新的生物還會出現。
