京市從2009年起，在全國率先施行對全市戶籍0-6歲兒童免費健康體檢，2011年又擴展到常住人口兒童。0-6歲是兒童生長髮育最快的時期，通過健康體檢，瞭解兒童生長髮育及健康狀況，發現生長有無異常情況，及時服務和治療，可以促進兒童健康成長，對其一生的發展都是至關重要的。在健康體檢中，向家長普及科學育兒常識，解決家長在護理和餵養中存在的問題，有針對性地進行指導，也可以最大限度地保障兒童健康發育。
據統計，2011年，北京全市各兒童體檢機構爲0-6歲兒童體檢總數達到75萬人，覆蓋率達到90%以上。檢出低體重兒童1千多人，生長遲緩兒童1200餘人，消瘦兒童1300多人，貧血患病兒童2.2萬多人，肥胖兒童2萬多人，3-6歲患齲兒童1.3萬多人，4-6歲視力不正常兒童1.4萬餘人，聽力異常兒童500多人。
據瞭解，凡北京市戶籍或父母雙方均爲北京市常住人口的0-6歲兒童都可享受到免費健康體檢服務。體檢時間和次數爲：1歲以內的兒童體檢4次，分別在2或3月齡、5或6月齡、8或9月齡、11或12月齡；1歲兒童體檢2次，分別在 1歲5或6個月、1歲11月或2歲的第一個月；2歲兒童體檢2次，分別在2歲5或6個月、2歲11或3歲的第一個月；3歲及以上兒童每年體檢一次。
體檢地點爲0-6歲兒童現居住地附近的社區衛生服務機構或區縣衛生行政部門指定的承擔兒童保健任務的醫療保健機構。家長應遵照時間帶孩子進行健康體檢。目前，北京市0-6歲兒童免費定期健康體檢的項目有：新生兒家庭訪視、體格測量及評價、內科檢查、口腔檢查、聽力檢查、視力檢查、智力篩查，兒童貧血篩查，並開展兒童餵養、防病指導以及健康狀況評估等。
對健康體檢中發現問題的兒童，服務部門均有連續的服務管理制度，即：建立專案、診斷、治療、隨訪、康復、結案等幾個接續環節。比如，發現兒童常見的營養不良、缺鐵性貧血、維生素D缺乏性佝僂病、肥胖等健康問題後，都要爲這些兒童設立專門的指導方案，凡在社區不能解決的病症，都要轉入相應的大中型醫院進行診療。兒童保健醫生還會定期隨訪，幫助家長對有健康問題的兒童進行矯治。
