病因和病理機制尚不明確，可能和以下原因有關。
1，遺傳因素：口吃患者家族發病率可達36%～55%，故有人認爲與遺傳因素有關，可能爲單基因遺傳，也有人發現口吃患者及親屬中左利手多見，認爲口吃與大腦優勢側有關。
2，軀體因素：較多兒童圍產期或嬰幼兒期曾受到有害因素作用，如胎兒期母體患妊娠毒血症，出血或軀體性疾病，或發育過程中患某些傳染病使神經系統功能弱化，言語功能受累而致口吃。
3，精神因素：兒童口吃往往發生在急性或遷延性精神創傷之後，因而不少學說認爲精神因素可能爲口吃的重要發病原因。
4，其它因素：有的學齡前兒童罹患口吃是因模仿所致，有資料則根據腦電圖，發音肌肌電圖和氟哌啶醇臨牀療效，推斷口吃可能與邊緣系統和網狀結構複合體活動增強，發音肌功能不協調，和基底節存在生化障礙等因素有關，但尚待臨牀進一步論證。
總之，口吃可能是生理與心理多種因素綜合作用的結果。
