不僅是陰道滴蟲感染，發生其他陰道炎時也要求患者堅持治療，完成治療療程。陰道毛滴蟲是一種單細胞原蟲，有很強的生活能力。當生存環境不適合它生長時，滴蟲就會變成球形體，活動明顯減弱，對外界環境的敏感性也降低。治療滴蟲病主要使用的是硝基咪唑類藥物，有口服和外用兩種治療方法。口服藥是爲了消滅尿道、尿道旁腺、前庭大腺及子宮頸管等處潛藏的滴蟲，這些部位的滴蟲單靠外用藥是很難消滅的。如果僅用局部陰道治療，即使將陰道內的滴蟲殺滅了，尿道等處未被消滅的滴蟲還可以繼續生長，源源不斷地進入陰道，使陰道滴蟲病久治不愈；也許在局部藥物的作用下，陰道滴蟲暫時改變了生存方式，患者如果不堅持治療，藥力過後滴蟲可能又恢復生存活力，繼續生長。因此，患者在治療中應該採取口服與外治同時使用的辦法，並且堅持治療。但是，有些人服用滅滴靈後會出現噁心嘔吐、厭食、口中有金屬味、腹瀉等不適症狀，這些都是滅滴靈的副作用，患者如果能耐受，就不要中斷治療，否則滴蟲得不到完全殺滅，有可能“東山再起”，反覆致病。雖然滴蟲不容易對滅滴靈產生抗藥性，但確實有抗藥株存在。因此建議患者用藥治療應該充分完成療程，以達到徹底治癒的目的。對滅滴靈有胃腸道反應的患者可以採用飯後服藥，以減輕其胃腸道的副反應。如果在服藥過程中出現藥物疹、白細胞減少，或頭暈、精神錯亂等中樞神經系統症狀，應該停止用藥。口服替硝唑的副反應一般小於滅滴靈，療效也不錯，可以作爲滅滴靈的替代用藥。
那麼，只用口服藥，不進行陰道治療行不行呢？要知道，患滴蟲性陰道炎時外陰、陰道充血，女性有陰癢、外陰疼痛、白帶量多等許多不適症狀。陰道用藥可以使藥物直接作用於陰道內的滴蟲，創造不利於滴蟲生存的環境，減輕局部炎性反應，減少患者痛苦。
滴蟲性陰道炎常在月經後復發。因此經過治療，症狀消失、陰道分泌物顯微鏡檢查滴蟲爲陰性時，也要在月經乾淨後去醫院複診，進行婦科檢查及陰道分泌物複查，連續3個月，都爲陰性時纔算徹底治癒。
