首先，自來水中含有多種礦物質，會對加溼器的蒸發器造成損害，其中所含的水鹼也會影響其使用壽命。
另外，自來水中含有一定量的氯原子和微生物，有可能隨水霧吹入空氣中造成污染。有些小區的自來水硬度較高，加溼器噴出的水霧中因含有鈣鎂離子，會產生白色粉末，不僅污染室內空氣，還會損壞傢俱、地板表面的油漆，影響光澤度，造成永久損傷。
還有些家庭會在水中加入芳香劑，這種做法也是不妥的。因爲芳香劑中所含的揮發性有機化合物成分容易引發呼吸道疾病，特別是對有呼吸道過敏史的人刺激更大。
注入加溼器中的水最好是蒸餾水或涼白開水，因爲經過處理後，水中所含雜質較少，人不會因爲吸入雜質而引起呼吸道不適。
最後，在日常生活中，要注意經常清洗加溼器，因爲有些病菌容易在溼熱環境中生存，如果加溼器本身不衛生，病菌就會隨水蒸氣漂浮在空氣中，對人的健康造成危害。
除了使用加溼器，在房間內掛條溼毛巾，或在角落裏灑些水，也能增加房間的溼度。
