中醫理論認爲，“腎”爲先天之本，“腎”的功能主藏精、主生長、發育和生殖，開竅於耳及二陰。其所藏的先天之精是生殖、發育的根本。精子的生成有賴於腎陰的滋養和腎陽的溫煦；腎主命門之火是促進生殖、發育的動力；其司前陰的功能直接主宰着外生殖器勃起與排精的功能。中醫的“肝”、“心”、“脾”、“肺”、“腎”並不等同於西醫所講的“肝臟”（liver）、“心臟”（heart）、“脾臟”（spleen）、“肺臟”（lung）、“腎臟”（kidney），中醫使用這些名稱已有2千年以上的歷史，由現代醫學的角度來看這些名詞，它們的內涵比較像是對於人體解剖生理功能分類的集合性統稱。目前對於中醫之“腎”所進行的研究證實，“腎”類似於“下視丘—腦垂體—性腺”軸的作用。針對“腎陽虛”所作的研究則顯示了腎陽虛證不僅可引起“下視丘—腦垂體—腎上腺皮質＂軸功能紊亂，而且對於不同靶腺軸（如下視丘—腦垂體—甲狀腺軸/胸腺軸/性腺軸）的不同環節，均可引起不同程度的功能紊亂和退行性病變。所以，腎氣的盛衰實際上反映了內分泌的功能狀態及體質的狀況，也決定着生育能力的強弱。“腎虛”是男性不育的主要病理機制，研究顯示補腎中藥在調整“下視丘—腦垂體—性腺”軸的功能和內分泌異常，改善精子的質量，調節免疫機能等方面有所幫助。補腎法促進睾丸生精原理的研究證實，補腎藥對睾丸有專一作用，有類似但又不完全等同於性激素和促性激素的作用，能促使損傷的睾丸組織（曲細精管及間質細胞等）得到改善和恢復。此外，男性不育症患者病程較長，多爲久病。中醫理論認爲“久病必有瘀＂、“怪病必有瘀＂，“瘀血＂往往是在以往的慢性炎症、組織損傷基礎上造成血運不暢，從而導致局部組織失養。因此，瘀血是男性不育的另一個主要病理機制。活血化瘀是中醫的一個重要理論和治療原則，活血化瘀類的中藥可改善血液循環及神經營養，促進損傷組織的修復，改善血液理化性質，有助於改善睾丸及附睾功能。
儘管近10年來國內關於中醫藥治療男性不育的研究有很多，但其中仍存在一些問題需要進一步解決：
1. 各種報導的療效差異性頗大，約在25%~95%之間，療效標準不統一，減少了不同治療方案之間的可比性。
2. 有的研究納入的病例不多，無對照組，故其療效有待進一步確認。
3. 對於精液異常的患者，即使不經過治療，在婚後的最初幾年仍有使配偶受孕的可能，因此將配偶懷孕作爲治癒標準有欠妥當。
除了藥物治療以外，患者的日常飲食生活習慣也需要注意。《濟陰綱目》中記載“聚精之道，一曰寡慾，二曰節勞，三曰息怒，四曰慎味”。《婦科玉尺》亦謂“男子求嗣，所謂清心寡慾”。因此，在治療過程中，應注意精神與生活方面的調節，緩解精神壓力，穩定情緒，對男性不育症的治療很重要。“慎味”就是飲食方面要注意，營養要均衡，不要偏食，蛋白質的補充固然不可少，新鮮蔬菜、水果等食物亦不可忽略，辛辣刺激、重口味的料理及垃圾食物應儘量避免。戒除菸酒也是一大重點。據研究顯示，酗酒對於“下視丘—腦垂體—性腺”軸、睾丸、精子均有毒性作用；香菸中的尼古丁已被證明是一種助氧化劑，它會透過不同的途徑來影響男性生殖能力，包括改變精子形態和存活率。此外，一些物理及化學因素，如：放射線治療和化學治療、熱能、電磁輻射、重金屬（如鉛、汞、鎘等）、有機氯化合物（如：多氯聯苯），對男性生殖功能亦有一定的影響。
