肝性腦病治療應採取綜合措施。積極消除誘因，避免或阻斷肝性腦病的發生和進一步發展是最基本的治療策略。促進氨的代謝。維持水、電解質及酸鹼平衡。恢復腦細胞功能。藉助非藥物性治療手段或裝置，初步糾正由於肝功能衰竭所產生的嚴重代謝紊亂。肝移植等。按一定的程序積極防治肝性腦病。或者通過中醫治療。
由於肝性腦病的病因、發病機制及臨牀表現異常複雜，因此，對於本病的治療，應以祛除誘因、維持機體內環境穩定、降低血氨、糾正氨基酸比例失調、對症治療及防治併發症等綜合治療措施爲主，必要時行人工肝支持或肝移植治療。
1、祛除誘因。許多因素可促發或加劇肝性腦病，多見於慢性肝病患者。對能找到誘發因素者，力爭及早祛除和防治誘因：
（1）預防並及時治療消化道出血：預防門靜脈高壓症並上消化道出血最根本的辦法是降低門靜脈高壓或治療食管胃底靜脈曲張。
（2）預防和控制各種感染：如腸道感染、原發性細菌性腹膜炎、墜積性肺炎、褥瘡感染及敗血症等，常是肝性腦病的重要誘因，應及時合理地給予抗感染治療。
（3）防治便祕可給予乳果糖、山梨醇、果導、番瀉葉、大黃、山梨醇、硫酸鎂等酌情口服，也可給予甘油/氯化鈉（開塞露）塞肛，必要時給予清潔灌腸。
（4）預防和糾正電解質及酸鹼平衡紊亂。
（5）慎用鎮靜藥，禁用含硫、含氨藥物，嚴禁大量放腹水，減少手術、創傷及利尿過多等，祛除醫源性因素。
2、維持機體內環境穩定
（1）維持電解質及酸鹼平衡：肝性腦病多見低鉀、低鎂、低鈣、低氯血癥，代謝性或呼吸性鹼中毒，應積極防治，特別是患者出現稀釋性低鈉血癥，處理相當困難，可能是因爲鈉泵衰竭，常預示患者進入終末期，應特別注意積極防治。
（2）飲食及營養：每天給予1500～2000ml液體量，可通過飲食、胃管給予，也可靜脈補充，以維持機體的基本營養代謝所需，對維持正氮平衡極爲重要。在保證足夠熱量的同時補充維生素、微量元素等。要嚴格限制蛋白質的攝入，旨在減少氨等其他毒性代謝產物的來源。昏迷期應禁用蛋白。主要通過給予葡萄糖、肝用氨基酸輸液（支鏈氨基酸）、新鮮血及少量脂肪等維持。患者甦醒後即應逐漸恢復蛋白質飲食，開始時先給予每天20g蛋白質，以後逐步增加蛋白質至每天40～60g。蛋白質以植物蛋白爲主，輔以乳製品。可按下述順序給予飲食：1、葡萄糖液口服2、米湯加葡萄糖3、米粥加葡萄糖4、米粥5、低蛋白半流質6、普通半流質。
飲食的增量速度不宜過快，約需2周。給水量應以前一天尿量加500～1000ml爲宜，可酌情調整。併發腦水腫者應嚴格限制入水量，每天一般不宜超過1500ml。
