多由血熱腸燥，大便祕結，排便過於用力，使肛門皮膚破裂，反覆感染而發病。《醫宗金鑑 • 外科心法要訣》中說：“肛門圍繞，折紋破裂，便結者，火燥也。”扼要闡述了因熱結腸燥，或因陰虛津乏而致大便祕結，排便過於用力，使肛門皮膚裂傷，隨後又繼發感染，逐漸形成慢性梭形潰瘍。但也有因肛管狹窄、肛門溼疹、痔瘡損傷等感染而發病的。具體說來，本病的發生與下列因素有關：
1.解剖學因素：肛門外括約肌淺部，從尾骨起，向前至肛門後方，分爲二束，沿肛管兩側向前圍繞，至肛門前方，又相聯合。因此，在肛門前後都留有空隙。並且肛提肌的大部分均附着於肛管兩側，前後較少。由此可見，肛門前後方不如兩側牢固，容易受損傷;肛管向下、向後與直腸壁形成一近 90 度的角，因此，肛門後部受糞便壓迫較重;又因肛管後部血液循環不足，彈性較差，肛門腺分佈又較多，這些都是發生肛裂的因素。
2.外傷因素：乾硬的糞便或異物，容易引起肛管皮膚的損傷，也是產牟肛裂的基本原因。
3.感染因素：主要是肛門後部的肛隱窩感染，炎症向肛管皮下部蔓延，致使皮下膿腫，破潰而成。
4.內括約肌痙攣因素：由於肛管部位損傷或炎症刺激，使肛門括約肌處於痙攣狀態，致使肛管張力增強。
