中國中醫研究院廣安門醫院主任李國棟醫師解釋道，洗腸對有些疾病引起的皮膚病有一定的效果，比如說由內分泌失調引起的黃褐斑。而對有些女性因爲使用不良化妝品引起的色素沉澱，是沒有效果的。
專家人士表示 洗腸偶爾一用，是治療便祕，排出積儲多日堅硬如石糞塊的一種治療方法，一定程度上可起到降血脂，清宿便的作用。但操作規程要求十分嚴格，要求一人一管，即進出水管必須是一次性使用，並由正規專業醫護人員實施纔可靠，也只能偶爾一用。對有嚴重痔瘡、過度虛弱、嚴重心臟疾病、高血壓、貧血、前期懷孕和剛接受過手術的人是禁止使用的。
腸道內有大量的菌羣相互依存，相互制約，起着天然的防禦屏障作用，以對抗致病菌的繁殖和作祟。人爲洗腸，會破壞腸腔這一防禦屏障的生態平衡，導致腸道菌羣失調，使致病菌乘虛而入，引起腸道感染。因此不提倡經常灌腸，長期洗腸可導致肛門括約肌鬆弛，便意不敏感，出現繼發性便祕。
