淋球菌感染引起的臨牀表現取決於感染的程度，機體的敏感性，細菌的毒力，感染部位及感染時間的長短。同時和身體的健康狀況，性生活是否過度，酗酒有關。根據臨牀表現，淋病可分爲無合併症淋病與有合併症淋病;無症狀與有症狀淋病;播散性淋病及急性與慢性淋病等。
引起播散性淋菌感染的菌株多爲AHU-營養型，該菌株對正常人血清具有穩定的反抗力，另外正常人血清中有對淋球菌脂多糖的IgM抗體，在補體的協助下，對大多數淋菌是有殺菌作用，缺乏C5、C6、C7和C8等補體成份的病人很輕易患淋菌性敗血症或淋菌性腦膜炎其次有淋菌性關節炎、淋菌性角化症、淋菌性心內膜炎。
抗生素使用前幾十年中，淋球菌是心內膜炎的主要病原體，目前淋菌性心內膜炎幾乎見不到，淋菌性心內膜炎和其他類型心內膜炎有相同的臨牀表現。心內膜炎時，常累及主動脈瓣或二尖瓣，因瓣膜的快速破壞所致的亞急性或急性心內膜炎，而導致死亡。
