消化系統疾病及功能紊亂：
如腹脹、腹瀉或便祕等情況。
內分泌變化：
有些女性患者往往在月經期發生，可能與體內雌激素量下降有關。
精神因素：
有的患者在精神緊張、情緒波動、睡眠狀況不佳的情況下發病，可能與植物神經功能失調有關。
遺傳因素：
如父母雙方均患有複發性口腔潰瘍時，其子女約有80— 90％患病，若雙親之一患此病時，其子女約有50—60％患病。
其他因素：
如缺乏微量元素鋅、鐵、葉酸、維生素B12等，可降低免疫功能，增加複發性口腔潰瘍發病的可能性。
