小兒癲癇疾病作爲癲癇中最爲常見的一種類型，它的頻繁出現並非偶然。通過對小兒癲癇的深入研究發現，導致小兒癲癇出現的病因很複雜，存在多樣性、多變性的特點，不少因素都是小兒癲癇的直接或是間接病因，不少還是小兒癲癇的誘發因素。
雖然小兒癲癇的病因十分複雜，但隨着醫學科技的快速發展，大部分病因已被人們明確認識，總體來講從病因學上可將癲癇分作兩大類：一類是沒有明確病因的癲癇，這一類癲癇佔癲癇患者總數20%，大多與遺傳有關，因此也稱作隱源性癲癇或遺傳性癲癇，另一類是可查出明確病因的癲癇。
在小兒癲癇的病因中一般包括下列幾種原因。①先天腦發育畸形，如無腦回畸形，巨腦回畸形，多小腦回畸形，灰質異位症，腦穿通畸形，先天性腦積水，肼胝體發育不全，蛛網膜囊腫，頭小畸形，巨腦症等。②神經皮膚綜合症：最常見的有結節性硬化，神經纖維瘤病和腦三叉血管瘤病等。③遺傳代謝病，如苯丙酮尿症、高氨血癥、腦脂質沉積症、維生素B6依賴症等。
導致小兒癲癇疾病的病因遠不止上文中提到的這幾種，話雖如此，但這幾種病因卻是小兒癲癇衆多病因中最爲常見的一些病因。我們不容忽視遺傳因素對小兒癲癇病的影響，在小兒癲癇的所有類型中，遺傳因素都是它們的主要病因之一。
