(一)塗片檢查
取患者尿道分泌物或宮頸分泌物，作革蘭氏染色，在多形核白細胞內找到革蘭氏陰性雙球菌。塗片對有大量膿性分泌物的單純淋菌性前尿道炎患者，此法陽性率在90%左右，可以初步診斷。女性宮頸分泌物中雜菌多，敏感性和特異性較差，陽性率僅爲50-60%，且有假陽性，因此世界衛生組織推薦用培養法檢查女病人。慢性淋病由於分泌物中淋球菌較少，陽性率低，因此要取前列腺按摩液，以提高檢出率。
咽部塗片發現革蘭氏陰性雙球菌不能診斷淋病，因爲其他奈瑟菌屬在咽部是正常的菌羣。另外對症狀不典型的塗片陽性應作進一步檢查。
(二)培養檢查
淋球菌培養是診斷的重要佐證，培養法對症狀很輕或無症狀的男性、女性病人都是較敏感的方法，只要培養陽性就可確診，在基因診斷問世以前，培養是世界衛生組織推薦的篩選淋病的唯一方法。目前國外推薦選擇培養基有改良的Thayer-Martin(TM)培養基和NewYorkCity(NYC)培養基。國內採用巧克力瓊脂或血瓊脂培養基，均含有抗生素，可選擇地抑制許多其他細菌生長。在36℃，70%溼度，含5%-10%CO2(燭缸)環境中培養，24-48小時觀察結果。培養後還需進行菌落形態，革蘭氏染色，氧化酶試驗和糖發酵試驗等鑑定。培養陽性率男性80%-95%，女性80-90%。
(三)抗原檢測
1.固相酶免疫試驗(EIA)：可用來檢測臨牀標本中的淋球菌抗原，在流行率很高的地區而又不能作培養或標本需長時間遠送時使用，可以在婦女人羣中用來診斷淋球菌感染。
2.直接免疫熒光試驗：通過檢測淋球菌外膜蛋白I的單克隆抗體作直接免疫熒光試驗。但目前在男女二性標本的敏感不高，特異性差，加之實驗人員的判斷水平，故該實驗尚不能推薦用來診斷淋球菌感染。
