水果雖然大多生長在樹上，但因使用農藥和在摘取、包裝、運輸、銷售過程中的損壞，往往會被污染，其污染程度與水果的表皮是否破損有關。表皮破損的水果，細菌污染率較高，如不好好消毒，常易導致腸道傳染病的發生。
消毒水果最好的方法是沸水(快速)消毒法，簡便經濟，效果又好。操作過程是先用肥皂將水果刷淨，再用自來水沖洗，然後放入沸水中充分浸泡，時間約30秒鐘，最後削皮。某些水果如葡萄、草莓、楊梅等無法用肥皂清洗，則可用自來水漂洗後再用高錳酸鉀溶液浸泡，高錳酸鉀溶液的濃度以配成淡紅色爲度。浸泡10分鐘後，取出用冷開水沖洗乾淨即可食用。如果沒有高錳酸鉀，用濃鹽水浸泡亦可。
水生植物，如紅菱和荸薺等都有可能被薑片蟲囊幼污染，不宜生食，應該洗淨後煮熟。由刀切開食用的水果，如西瓜，也應將外皮用肥皂冼淨，纔好用消過毒的水果刀切開，萬勿將切菜刀公用。
蔬菜冷拌要注意衛生。常吃的有海帶、芹菜、番茄等，先要充分洗淨，然後用沸水燙過。切菜要用切熟食的刀具和砧板。拌時加少許醋，具有消毒作用。番茄生吃，還要剝皮、去子、加糖，待入味後食用。操作人員的手一定要用肥皂洗淨，保證清潔衛生。
