藿香正氣水適用於暑月外感風寒、內傷生冷所致的惡寒發熱、頭痛脘痞、嘔吐腹瀉等，多用於內服。臨牀觀察發現，其外治亦有諸多新功效，介紹如下，供選用。
1.吳萸粉10克，用藿香正氣水調勻，外敷於肚臍孔處，再用傷溼止痛膏固定，每日換藥1次，連續3天。可芳香化溼、理氣止痛，適用於暑溼或寒溼泄瀉。
2.丁香、黑胡椒各等份，共研細末，裝瓶備用。使用時每次取藥末適量，用藿香正氣水調勻，外敷於肚臍孔處，敷料包紮，膠布固定，每日換藥一次，連續3天。或取車前子、丁香、肉桂、枯礬各等份，共研細末，用藿香正氣水調糊，外敷於肚臍孔處，再用傷溼止痛膏固定，每日換藥一次，連續3～5天。可溫中固下、芳香化溼、理氣止痛，適用於慢性結腸炎。
3.丁香、肉桂各等份，共研細末，裝瓶備用。使用時每次取藥末適量，用藿香正氣水調勻，外敷於肚臍孔處，再用傷溼止痛膏固定，每日換藥一次，連續3天。可芳香化溼、理氣止痛，適用於小兒秋瀉。
4.取藿香正氣水適量，用消毒棉籤蘸藥液外搽患處，每日3～5次，連續3～5天。可祛溼止癢，適用於小兒瘙癢性皮膚病。
5.黃芪10克，蒼朮6克，丁香4克，冰片1克。共研細末，裝瓶備用。每次使用時取藥末適量，用藿香正氣水調爲稀糊狀外敷肚臍孔處，敷料包紮，膠布固定，每日換藥一次，連續7～10天。可益氣健脾，適用於小兒反覆呼吸道感染。
6.取藿香正氣水適量，用消毒棉籤蘸藥液外搽患處，每日3～5次，連續3～5天。可祛溼止癢，適用於陰囊溼疹。
7.取藿香正氣水加等量冷開水混勻。用藥前洗淨患處，並用生理鹽水沖洗消毒，而後取上藥外部塗擦，每日3～4次，連續3～5天。可清熱祛溼，適用於小兒癤病。
8.將患處洗淨，取藿香正氣水少許塗搽於患處，接着用手輕輕地揉搓，直至局部發熱，每日3次，連續一週。可活血通絡、消腫止痛，適用於凍瘡初起、局部紅腫硬痛者，凍瘡破潰者不宜。冬季來到後，每日取本品少許外搽患處，還可預防凍瘡。
9.凌霄花100克，加水1500毫升，水煎30分鐘，去渣取汁，加藿香正氣水兩支，混合均勻，坐浴並洗滌患處，每日兩次，連續3～5天。可祛風除溼、止癢止痛，適用於陰癢。
10．取藿香正氣水兩支，倒入浴水中洗浴，每日兩次，連續3天。可祛暑利溼，防治小兒暑痱。
11．取藿香正氣水一瓶，用棉球浸透後，放置於肚臍孔處，再用傷溼止痛膏固定，每日換藥1～2次，連續3天。可芳香化溼、理氣止痛，治療小兒感寒、傷食腹痛。
