附睾、輸精管、精囊和前列腺等生殖道或生殖腺體的急慢性炎症都可降低精子的運動能力，感染對精子活力的影響可以是多方面的。
例如，微生物對精子的直接作用，如支原體可以吸附於精子的頭部、中段及尾部，使精子作前向運動時，流體動力學阻力加大，運動速度減慢，影響精子活力及穿透卵細胞的能力。此外，支原體可造成部分精子膜缺損甚至膜結構破壞，影響精子的受精能力。
大腸桿菌可通過自身的受體與精子發生結合降低精子活力;微生物對精子的間接作用，可以通過產生或釋放毒性物質，支原體在生長過程中產生NH3對精子有直接毒性作用。
感染造成精子活力下降還可以通過改變精漿pH值來達到，當pH值低於7或高於9時，精子活力下降明顯。
急性附屬性腺炎症或附睾炎症病人，pH多偏鹼，而慢性附屬性腺炎可使pH值低於7以下。此外，炎症引起的精液中白細胞增多，可以通過直接和間接的原因導致精子運動的下降。前列腺炎引起精子活力不足可能是多種因素綜合的結果，除微生物、白細胞、pH值等因素外，還可能與鋅的障礙有關。
