藥物流產的副作用最小的也容易引起月經失調，表現爲月經週期縮短或延長，月經量增多。而對於未生育的婦女來說，如果反覆使用，不僅容易引起感染或大出血，還有可能導致不孕，造成終身遺憾。
一、感染女性服用抗孕藥物後，子宮腔內的胚囊組織可在當天排出，有時妊娠組織物排出不全，子宮膜復舊欠佳，陰道出血時間較長，可持續2-3周，甚至1-2個月。長期慢性失血可引起貧血，使身體抵抗力下降。這時，細菌往往由陰道逆行，而引起子宮內膜炎症。
二、不完全流產 有的女性用藥後因不完全流產，影響子宮收縮及子宮內膜創面的修復，使陰道流血量明顯增多，超過平時月經量的2-3倍，嚴重者還可出現大出血，導致貧血、休克，此時需輸血、並緊急手術刮宮止血等。
三、影響以後的正常妊娠 未婚女性如反覆妊娠、反覆流產，可造成子宮內膜反覆受損。由於子宮內膜有損傷，一旦她們需要正常妊娠，易發生前置胎盤，可引起產前大出血，也有些女性由於多次人工流產而出現習慣性流產。
四、月經失調 抗孕藥物可以抑制卵巢的功能，影響卵泡的生長髮育甚至排卵。個別女性藥物流產後，可發生月經失調，表現爲月經週期縮短或延長，月經量增多。
其實，不管手術刮宮還是藥物流產，除了對肉體上的損傷外，其引起的激素變化對人體的傷害也是難以察覺的。肉體上的損傷很快就可以修復，但內分泌變化對人體的打擊卻不是一天兩天就能恢復過來的。
而且，由於藥物流產會留下一定的併發症，因此，目前醫學上規定，藥物流產只能在具有一定設備的醫療保健機構中使用，以便在出血多或出血時間較長的情況下進行手術刮宮，以及抗感染，輸液和輸血治療。
所以，千萬不要在家用隨意濫用，應該由有經驗的婦產科醫生根據具體情況來決定。
