內膜異位導致疼痛
還有一些性交疼痛，發生在已有正常性生活的女性中，可以發生在性生活開始時、進行中或者結束後，部位可以在外陰、陰道或是盆腔深部、下腹部。如果症狀持續存在，應該到醫院就診。
這種性交疼痛往往是由陰道、盆腔炎症導致，或者是發生了子宮內膜異位症，性交時碰到了盆腔中的異位症病竈引起。這些情況的性交痛是疾病的症狀之一，治療以祛除疾病爲主，病好了性交疼痛自然也就緩解了。
在一些生理時期，即幼女或青春期未發育成熟、妊娠期、哺乳期和老年期，即使沒有器質性疾病，也會出現性交痛，主要是由於體內激素水平的變化出現陰道局部黏膜變薄，在性交陰莖抽動時陰道的耐受能力降低。
陰道痙攣導致疼痛
陰道痙攣是指在性交時陰道口的肌肉發生不隨意的痙攣，造成陰道口緊閉致使男性生殖器無法插入，或者即便插入也造成女方的疼痛。出現陰道痙攣，一部分是由於先天結構異常，或炎症引起疼痛繼發痙攣，但大部分是由於缺乏性知識或幼年時有創傷的經歷，或男方性交動作不當導致。尤其是在雙方均沒有性經驗時，第一次失敗後心裏留下陰影，更容易在今後的嘗試中手足無措。如果再次失敗，可能就此對自己失去信心。如不及時找出原因並加以糾正，就會錯過最佳治療時機，爲今後治療帶來困難。
對由於結構異常或炎症導致的陰道痙攣，可以通過藥物治療炎症、手術糾正結構異常，消除導致痙攣的直接病因。對於缺乏性知識的夫婦，需要傳授包括男女生殖器官解剖、性交的基本知識技巧。女性通過脫敏療法，可增強性交成功的信心，提高陰道的耐受能力，絕大多數夫婦都可以建立正常的性生活。
