肛門直腸疾病必須進行仔細的肛門檢查，結合詳細詢問所得的病史，才能作出明確的診斷，因此掌握檢查方法十分重要。檢查時注意事項如下：
檢查時，操作必須輕柔，勿使患者感到痛苦，並事先告訴患者，給予適當的解釋和安慰。不可在患者毫無思想準備的情況下突然進行，以免患者恐懼而不協作。作肛門直腸檢查時要取適當的姿勢，然後告訴患者張口作深呼吸或排便動作。在指套或肛門鏡上塗以潤滑劑，先在肛門口輕輕按摩，待肛門部鬆弛時再徐徐插入。
肛門直腸疾病在進行檢查和治療時，常用下述幾體位。各種體位有一定的優點，應根據檢查和治療的要求選用一種或兩種體位。
1、側臥位
患者向左或右側臥，雙腿充分向前屈曲，靠近腹部，使臀部及肛門充分暴露，是常用的檢查與治療的體位。
2、倒置位
患者俯臥牀上，膝關節彎曲，兩膝跪於牀端，臀部擡高，頭部稍低。是肛門直腸手術時常用體位。
3、截石位
患者仰臥，兩腿放在腿架上，將臀部移到手術檯邊緣，使肛門暴露良好。是肛門直腸手術時常用體位。
4、蹲位
患者作蹲踞或向下用力增加腹壓，可查到Ⅱ、Ⅲ期內痔，脫肛、息肉痔。
5、膝胸位
患者跪伏在檢查牀上，胸部貼近牀面，臀部擡高使肛門充分露出。適用於檢查直腸下部、直腸前壁和身體矮小肥胖患者。
6、彎腰扶椅位
患者向前彎腰，雙手扶椅，露出臀部。此種體位方便，不需要特殊設備，適用於團體檢查。
