目前所用的化療藥物大多數具有一定的毒性。會對人體或某些器官組織帶來一些不良反應。如果出現下列情況，應考慮暫停化療。
嚴重的消化道反應
使用化療藥物後，少數病人的消化道反應相當突出，如出現嚴重的口腔潰瘍，使進食吞嚥都有困難；或有腹痛、腹瀉，倘若腹痛嚴重，或腹瀉超過每日5次以上，甚至出現血性腹瀉，都應停藥，採取相應的治療措施。不少化療藥物用藥後有噁心嘔吐的發生，如氮芥、阿黴素、順氨氯鉑等。通常醫師都會採取適當的防範措施，以使其減輕這類反應。個別病人如此類反應已嚴重到難以忍受的程度，也可考慮停藥。
血象
每次使用化療以前患者都應檢查血象。如周圍血中白細胞計數不足4．0×109/L，血小板計數低於60×109/L，則應暫停化療。
發熱
用抗腫瘤藥物期間，體溫超過38℃以上，也應暫停化療或提前結束該療程治療。對於腫瘤所引起的發熱，腫瘤化療是一種手段。用藥恰當往往可使腫瘤消退，發熱控制。
出現重要臟器的毒性反應
如心肌損害、中毒性肺炎、中毒性腎炎、膀胱炎等。
