扁平苔癬的治療尚無滿意的療法。首先應消除精神緊張，治療慢性病竈，生活力求規律。針對有關因素予以治療。當損害侷限且無糜爛時，用2%~4%碳酸氫鈉溶液與0.2%洗必泰溶液交替沖洗，每日數次，並每月進行復查。發生局部糜爛事，局部糜爛區可敷複方類固醇粉，每日數次，甚者可用確炎舒鬆，注射於局部，每週2次，並加用抗生素。糜爛在脣紅部位者，可用膚輕鬆軟膏塗敷，每日數次。局部用抗黴菌治療也有一定的作用，制黴菌素50萬單位，口內含化，每日3~4次。全身用腎上腺皮質類固醇應慎重，施行小劑量、短程方案，如強的鬆5mg，每日3次，用1~2周，用藥期間做大便潛血及血壓檢查。也可用昆明山海棠2片，每日3次；雷公藤片3~4片，每日2次。還可口服維生素A、維生素A酸。去除機械性刺激因素，刮除磨牙頰面的牙石，避免牙刷毛等刺傷局部粘膜也是非常重要的。
扁平苔癬大致與中醫口蕈、口癬、口破、口疳等相似，多由熱毒和溼毒積聚，或氣滯血瘀，氣血失和，溼熱循經上逆，燻蒸於口，或肝鬱血虛，化火上炎而致。證屬脾胃溼熱者，治以祛溼清熱解毒，用平胃散合二妙散加減（蒼朮、厚朴、陳皮、薏苡仁、黃柏、夏枯草、土茯苓、藿香、佩蘭、生甘草）。證屬肝經實火者，治以清肝瀉火，用龍膽瀉肝湯加減（龍膽草、黃芩、梔子、柴胡、當歸、車前子、生地黃、澤瀉、木通、甘草）。證屬肝氣鬱結者，治以疏肝理氣解鬱，用丹梔逍遙散或柴胡清肝湯加減（柴胡、當歸、白芍、梔子、丹皮、茯苓、黃芩、川芎、香附、鬱金、連翹、炙甘草）。證屬血虛風燥者，治以滋陰養血、疏風潤燥，用苔癬一號加減（當歸、生地黃、白芍、熟地黃、麥冬、女貞子、枸杞子、白鮮皮、牛膝、香附、旱蓮草）。證屬陰虛內熱者，治以滋陰清熱，用六味地黃湯加減（生地黃、熟地黃、丹皮、茯苓、澤瀉、山藥、山茱萸、黃柏、知母、梔子、麥冬、旱蓮草、天花粉、石斛）。證屬氣血兩虛者，治以益氣養血，用八珍湯加減（黨蔘、黃芪、白朮、茯苓、澤瀉、當歸、制黃精、白芍、熟地、何首烏、石斛）。證屬氣滯血瘀者，治以活血祛瘀，用血府逐瘀湯加減（當歸、桃仁、紅花、川芎、赤芍、柴胡、香附、生地黃、玄蔘、陳皮、甘草）。局部可用青黛、爐甘石、孩兒茶、冰片塗潰瘍面；吳茱萸末醋調敷涌泉穴；還可用青吹口散、雙料喉風散、解毒生肌散、柳花散、西瓜霜等中成藥，撒於患處。可用金銀花、玄蔘、生地黃煎水漱口。鍼灸治療可起到輔助作用，取穴俠溪、中渚，耳針取神門、交感、皮質下及壓痛點。
