雖然麻黃素滴鼻液在緩解鼻塞時可起到立竿見影的療效，但是隨着藥理學研究的深入，麻黃素的副作用昭然若揭，使我們不得不重新權衡它的利弊：
首先，麻黃素是α及β受體興奮劑，對心臟和中樞神經系統副作用較多，因此高血壓、冠心病、甲狀腺機能亢進、青光眼、前列腺肥大的患者應慎用。
其次，麻黃素對心臟有興奮作用，長期使用，會產生抑制，也可影響心率。特別是與洋地黃合用時，會加劇洋地黃對心臟的作用，易引起心率失常。
第三，如果長期濫用麻黃素，仍會造成逆轉反應，繼發性血管擴張，產生對藥物的依賴性，日久形成藥物性鼻炎。此外，個別患者對麻黃鹼過敏，滴鼻後可引起鼻、咽、喉的過敏反應，甚至震顫、心悸、失眠、焦慮等全身不適。
正是麻黃素滴鼻液的弊多利少，國外早在六十年代就開始限制麻黃素局部減充血劑的使用。國內鼻科專家也於今年提出“關於限制濫用麻黃素類鼻腔減充血劑的建議”。
